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NVIDIA為TOP500超級計算機加速、節(jié)能

西西 ? 來源:廠商供稿 ? 作者:NVIDIA ? 2020-06-23 17:02 ? 次閱讀
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NVIDIA為全球最快的10臺超級計算機中的8臺提供加速。 NVIDIA Selene成為美國速度最快的工業(yè)系統(tǒng),同時具有領先水平的能效表現。

最新TOP500超級計算機榜單展現了現代科學計算的整體情況:通過AI和數據分析進行擴展并使用NVIDIA技術提供加速。

目前,全球排名前十的超級計算機中有8臺采用了NVIDIA GPU、InfiniBand網絡技術,或同時采用了兩種技術。其中包括美國、歐洲和中國最強大的超級計算機系統(tǒng)。

在TOP500榜單的所有系統(tǒng)中,有三分之二的系統(tǒng)(333套)采用了NVIDIA(現已與Mellanox合并)為其賦力。而在2017年6月發(fā)布的榜單上,采用兩家公司的系統(tǒng)占比總和還不到一半(203套)。

如今,榜單上有將近四分之三(74%)的全新InfiniBand系統(tǒng)采用了NVIDIA Mellanox HDR 200G InfiniBand,這也展現了該最新智能高速數據互連技術的迅速普及。

自2019年11月以來,榜單上使用HDR InfiniBand的TOP500系統(tǒng)數量幾乎增加了一倍。共有141臺超級計算機使用了InfiniBand,自2019年6月以來增長了12%。

NVIDIA為TOP500超級計算機加速、節(jié)能

越來越多TOP500系統(tǒng)采用了NVIDIA GPU、Mellanox網絡技術,或同時采用了這兩種技術。

在TOP500超級計算機中,有305套系統(tǒng)使用了NVIDIA Mellanox InfiniBand和Ethernet網絡(占61%),包括所有141套InfiniBand系統(tǒng)和164套(占63%)使用Ethernet的系統(tǒng)。

在能效方面,使用NVIDIA GPU的系統(tǒng)表現也都脫穎而出。與不使用NVIDIA GPU的系統(tǒng)相比,其能效(以gigaflops/watt為單位)平均高出2.8倍。

這也是為何排在TOP500榜單前25的超級計算機中有20臺系統(tǒng)都選擇采用NVIDIA GPU的原因之一。

NVIDIA為TOP500超級計算機加速、節(jié)能

NVIDIA GPU提高了TOP500超級計算機的能效。

最能夠證明此能效表現的是NVIDIA內部研究集群的新成員—— Selene(如上圖所示)。該系統(tǒng)在Linpack基準測試中以27.5 petaflops的性能表現,在最新Green500榜單中排名第二,在整個TOP500榜單中排名第七。

Selene的功耗為20.5 gigaflops/watt,與Green500榜單上的第一名相差甚微,但排名第一的系統(tǒng)體積更小,其性能表現僅排在第394位。

Selene是排名前100系統(tǒng)中唯一突破20 gigaflops/watt能效表現大關的系統(tǒng),同時也是全球性能排名第二的工業(yè)超級計算機,僅次于意大利能源巨頭Eni S.p.A.的NO. 6 系統(tǒng)(同樣使用了NVIDIA GPU)。

在能效方面,相比于未使用NVIDIA GPU的其它TOP500系統(tǒng)的平均能效表現,Selene的能效高出了6.8倍。Selene的優(yōu)異性能和能效均要歸功于NVIDIA A100 GPU中的第三代Tensor Core核心。該核心可以為傳統(tǒng)的64位數學模擬及精度較低的AI工作提供加速。

Selene所取得的名次對于它來說已經是一項了不起的成就了,畢竟該系統(tǒng)只用了不到4周的時間就構建完成了。工程師們可以使用NVIDIA的模塊化參照架構,快速構建Selene。

該參考架構既NVIDIA的DGX SuperPOD。該系統(tǒng)基于強大而靈活的現代數據中心構建模塊 —— NVIDIA DGX A100系統(tǒng)。

高度靈活的DGX A100系統(tǒng)現已上市。該系統(tǒng)在一臺6U服務器中集成了8顆A100 GPU以及NVIDIA Mellanox HDR InfiniBand網絡技術,可以為高性能計算、數據分析和AI工作(包括訓練和推理)等多種組合提供加速,并實現快速部署。

從系統(tǒng)擴展至SuperPOD

參照該參考架構設計,任何企業(yè)機構都可以快速搭建屬于其自己的世界級計算集群。參照設計展示了如何像搭積木一樣使用高性能NVIDIA Mellanox InfiniBand交換機連接20臺DGX A100系統(tǒng)。

NVIDIA為TOP500超級計算機加速、節(jié)能

InfiniBand為排名前10的超級計算機中的7臺提速,其中包括中國、歐洲和美國性能最強大的系統(tǒng)。

4名操作人員僅需不到1個小時,就能組裝起一套由20臺系統(tǒng)組成的DGX A100集群,創(chuàng)建出一套性能可以達到2-petaflops的系統(tǒng),如此性能表現足以被列入TOP500榜單當中了。此類系統(tǒng)能夠在標準數據中心的功率和散熱能力承擔范圍內輕松運行。

通過添加NVIDIA Mellanox InfiniBand交換機層,工程師將14套分別配置有20臺DGXA100系統(tǒng)的模塊組的相連接,從而創(chuàng)造出了Selene。Selene系統(tǒng)具有:

·280臺 DGX A100系統(tǒng)

·2240顆NVIDIA A100 GPU

·494臺NVIDIA Mellanox Quantum 200G InfiniBand交換機

·56 TB/s的網絡架構

·7PB的高性能全閃存

Selene最重要的性能規(guī)格之一是可以提供超過1 exaflops的AI性能。此外,在TPCx-BB關鍵數據分析基準測試中,其僅使用了16臺DGX A100系統(tǒng)就創(chuàng)造了新紀錄,其性能表現高出其他系統(tǒng)20倍。

如今,AI和分析已成為科學計算中的新需求,因此這些結果也顯得格外重要。

在全球各地,研究者正在使用深度學習和數據分析預測各種最具潛力的領域,并進而開展實驗。這一方法能夠幫助研究者減少成本高昂且費時的實驗量,從而加快取得科學成果的速度。

例如,目前有6臺在建系統(tǒng)雖然沒有出現在此次TOP500榜單中,但它們都采用了NVIDIA于上月發(fā)布的A100 GPU。這些系統(tǒng)將被用于加速HPC和AI的融合,開辟科學研究的新時代。

TOP500擴展科學計算應用

在這些系統(tǒng)當中,其中一臺位于美國阿貢國家實驗室(Argonne National Laboratory)。該機構的研究者將使用24臺NVIDIA DGX A100系統(tǒng)組成的集群對數十億種藥物進行掃描,以尋找COVID-19的治療方法。

阿貢國家實驗室的計算生物學家Arvind Ramanathan在有關A100 GPU的首批用戶報告中表示:“這項工作中的一大難點在于在計算機上進行模擬,因此我們運用AI來指導下一步的采樣地點和時間?!?/p>

美國國家能源研究科學計算中心(NERSC)正在將AI應用于幾個針對Perlmutter的項目中,Perlmutter是該中心的pre-exascale系統(tǒng),擁有6200顆A100 GPU。

例如,其中一個項目將使用強化學習來控制光源實驗,另有一個項目將使用生成模型在高能物理探測器上重現復雜的模擬。

為了加快新冠病毒蛋白的分析速度,慕尼黑的研究者們正在依靠Summit超級計算機中的6000顆GPU訓練自然語言模型。有跡象表明,領先的TOP500系統(tǒng)正在超越使用雙精度數學運行的傳統(tǒng)模擬。

AI、數據分析和邊緣串流正在重新定義科學計算。

隨著向深度學習和分析的擴展,科學家們也在運用云計算服務,甚至運用來自于網絡邊緣的遠程儀器的流式數據。這些要素共同構成了NVIDIA所加速的現代科學計算的四個支柱:

·模擬:在抗擊新冠病毒的過程中,橡樹嶺國家實驗室(Oak Ridge National Laboratory)的研究者使用Summit超級計算機的內置GPU運行AutoDock,在24小時內模擬了20億種化合物。

·AI和數據分析:Spark 3.0 為關鍵且耗時的機器學習處理流程前端提供GPU加速。

·科學邊緣串流:歐洲核子研究所(CERN)最近宣布,NVIDIA GPU將使其大型強子對撞機內粒子碰撞事件產生的數據量減少500倍。

·可視化:NVIDIA的IndeX和Magnum IO軟件幫助增強火星登陸者號的可視化功能,這是全球規(guī)模最大的交互式實時立體可視化項目。

這些都表明研究者和企業(yè)都迫切需要從云到網絡邊緣的AI和分析加速,這也是為什么全球最大的云服務提供商以及全球頂尖的OEM廠商們都在采用NVIDIA GPU的原因。

此外,最新的TOP500榜單也以另一這種方式說明了NVIDIA為實現AI和HPC民主化所付出的努力。任何想要在計算能力上領先一步的公司都可以使用NVIDIA技術,如為全球最強大的系統(tǒng)提供支持的DGX系統(tǒng)。

最后,NVIDIA要向排名第一的日本Fugaku超級計算機的幕后工程師們表示祝賀,這表明Arm正在變得日益實用并且已經成為高性能計算的可行選擇。這也是NVIDIA在去年宣布為Arm處理器架構提供CUDA加速計算軟件的原因之一。

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