加速生命科學(xué)計(jì)算，賦能下一代新藥研發(fā)

近日，專用計(jì)算芯片研發(fā)與算力解決方案創(chuàng)新企業(yè)雪湖科技在全球超過55家參賽企業(yè)中脫穎而出，憑借“面向新藥研發(fā)的生命科學(xué)計(jì)算專用超算Yaddle”榮獲由賽靈思舉辦的“全球自適應(yīng)計(jì)算挑戰(zhàn)賽（Adaptive Computing Challenge 2020）”亞軍，這也是中國(guó)區(qū)及生命科學(xué)領(lǐng)域的唯一獲獎(jiǎng)企業(yè)。“Yaddle”由雪湖科技自主設(shè)計(jì)開發(fā)，賦能下一代基于動(dòng)態(tài)的藥物設(shè)計(jì)（motion-based drug design）。

雪湖科技獲“全球自適應(yīng)計(jì)算挑戰(zhàn)賽”亞軍

傳統(tǒng)新藥研發(fā)主要基于蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)，這一過程類似于“看照片”，僅能根據(jù)生物分子的靜態(tài)結(jié)構(gòu)猜測(cè)藥物與靶點(diǎn)的結(jié)合，成功率低。近年來，基于蛋白質(zhì)四維動(dòng)力學(xué)的藥物設(shè)計(jì)方法為新藥研發(fā)提供了更多可能性。通過“看視頻”，研發(fā)人員能清晰觀察并深入了解生物分子的動(dòng)態(tài)變化，發(fā)現(xiàn)藥物與生物分子之間的作用路徑。分子動(dòng)力學(xué)模擬將成為下一代新藥研發(fā)的必備工具。

從“看照片”到“看視頻”，大規(guī)模分子動(dòng)力學(xué)計(jì)算對(duì)算力提出了巨大挑戰(zhàn)。憑借在專用計(jì)算芯片領(lǐng)域深厚的積累，雪湖科技基于賽靈思強(qiáng)大的FPGA芯片，打造了“生命科學(xué)專用超算Yaddle”，助力藥物設(shè)計(jì)邁入“看視頻”的時(shí)代，縮短新藥研發(fā)周期，降低新藥研發(fā)風(fēng)險(xiǎn)，進(jìn)一步提升藥物發(fā)現(xiàn)的效率。“Yaddle”同時(shí)兼容常用分子動(dòng)力學(xué)軟件，助力新藥研發(fā)從基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)（structure-based drug design）升級(jí)到下一代基于動(dòng)態(tài)的藥物設(shè)計(jì)（motion-based drug design）。

“面向新藥研發(fā)的生命科學(xué)計(jì)算專用超算Yaddle”系統(tǒng)架構(gòu)

雪湖科技生命科學(xué)計(jì)算首席科學(xué)家盛楠博士表示：“目前，所有藥物的靶向蛋白質(zhì)在基因上占比僅5%，仍有大量疾病相關(guān)蛋白質(zhì)沒有靶向藥物，甚至有很多疾病的致病機(jī)理尚不清晰。隨著新藥研發(fā)步入‘算力時(shí)代’，雪湖科技計(jì)劃在年內(nèi)實(shí)現(xiàn)‘Yaddle’的正式商用，并歡迎新藥研發(fā)領(lǐng)域企業(yè)攜手合作，利用下一代基于動(dòng)態(tài)的藥物設(shè)計(jì)（motion-based drug design）加速新藥研發(fā)過程，為患者的生命健康帶去福音?！?/p>

“全球自適應(yīng)計(jì)算挑戰(zhàn)賽2020”由賽靈思舉辦，賽事從2020年夏季啟動(dòng)，吸引了全球頂尖FPGA開發(fā)者與創(chuàng)新企業(yè)參加，比拼如何借助賽靈思硬件平臺(tái)以創(chuàng)新技術(shù)解決現(xiàn)實(shí)問題。