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如何解決數(shù)據(jù)庫CPU使用率100%報警頻繁的問題呢

工程師鄧生 ? 來源:OSCHINA 社區(qū) ? 作者:京東云開發(fā)者 ? 2022-09-01 12:12 ? 次閱讀
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1 前言

近期隨著數(shù)據(jù)量的增長,數(shù)據(jù)庫 CPU 使用率 100% 報警頻繁起來。第一個想到的就是慢 Sql,我們對未合理運用索引的表加入索引后,問題依然沒有得到解決,深入排查時,發(fā)現(xiàn)在 order by id asc limit n 時,即使 where 條件已經包含了覆蓋索引,優(yōu)化器還是選擇了錯誤的索引導致。通過查詢大量資料,問題得到了解決。這里將解決問題的思路以及排查過程分享出來,如果有錯誤歡迎指正。

2 正文

2.1 環(huán)境介紹

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2.2 發(fā)現(xiàn)問題

22 日開始,收到以下圖 1 報警變得頻繁起來,由于數(shù)據(jù)庫中會有大數(shù)據(jù)推數(shù)動作,數(shù)據(jù)庫 CPU 偶爾報警并沒有引起對該問題的重視,直到通過圖 2 對整日監(jiān)控數(shù)據(jù)分析時,才發(fā)現(xiàn)問題的嚴重性,從 0 點開始,數(shù)據(jù)庫 CPU 頻繁被打滿。

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圖 1:報警圖

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圖 2:整日 CPU 監(jiān)控圖

2.3 排查問題

發(fā)現(xiàn)問題后,開始排查慢 Sql,發(fā)現(xiàn)很多查詢未添加合適的索引,經過一輪修復后,問題依然沒有得到解決,在深入排查時發(fā)現(xiàn)了一個奇怪現(xiàn)象,SQL 代碼如下(表名已經替換),比較簡單的一個單表查詢語句。

poYBAGMQMVOAOpvtAABHrDwPvaU298.jpg

看似比較簡單的查詢,但執(zhí)行時長平均在 90s 以上,并且調用頻次較高。如圖 3 所示。
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圖 3:慢 Sql 平均執(zhí)行時長 開始檢查表信息,可以看到表數(shù)據(jù)量在 2100w 左右。

69682524-292c-11ed-ba43-dac502259ad0.png

圖 4:數(shù)據(jù)表情況 排查索引情況,主鍵為 id,并且有 business_day 與 full_ps_code 的聯(lián)合索引。

pYYBAGMQMXKAJKg_AAC5df4wQwY672.jpg

通過 Explain 查看執(zhí)行計劃時發(fā)現(xiàn),possible_keys 中包含上面的聯(lián)合索引,而 Key 卻選擇了 Primary 主鍵索引,掃描行數(shù) Rows 為 1700w,幾乎等于全表掃描。 697ffca8-292c-11ed-ba43-dac502259ad0.png 圖 5:執(zhí)行計劃情況

2.4 解決問題

第一次,我們分析是,由于 Where 條件中包含了 ID,查詢分析器認為主鍵索引掃描行數(shù)會少,同時根據(jù)主鍵排序,使用主鍵索引會更加合理,我們試著添加以下索引,想要讓查詢分析器命中我們新加的索引。

ADD INDEX `idx_test`(`business_day`, `full_ps_code`, `id`) USING BTREE;
再次通過 Explain 語句進行分析,發(fā)現(xiàn)執(zhí)行計劃完全沒變,還是走的主鍵索引。

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圖 6:執(zhí)行計劃情況 第二次,我們通過強制指定索引方式 force index (idx_test) 方式,再次分析執(zhí)行情況,得到圖 7 的結果,同樣的查詢條件同樣的結果,查詢時長由 90s->0.49s 左右。問題得到解決

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圖 7:強制指定索引后執(zhí)行計劃情況

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第三次,我們懷疑是 where 條件中有 ID 導致直接走的主鍵索引,where 條件中去掉 id,Sql 調整如下,然后進行分析。依然沒有命中索引,掃描 rows 變成 111342,查詢時間 96s

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第四次,我們把 order by 去掉,SQL 調整如下,然后進行分析。命中了 idx_business_day_full_ps_code 之前建立的聯(lián)合索引。掃描行數(shù)變成 154900,查詢時長變?yōu)?0.062s,但是發(fā)現(xiàn)結果與預想的不一致,發(fā)生了亂序

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第五次,經過前幾次的分析可以確定,order by 導致查詢分析器選擇了主鍵索引,我們在 Order by 中增加排序字段,將 Sql 調整如下,同樣可以命中我們之前的聯(lián)合索引,查詢時長為 0.034s,由于先按照主鍵排序,結果是一致的。相比第四種方法多了一份 filesort,問題得解決。

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第六次,我們考慮是不是 Limit 導致的問題,我們將 Limit 500 調整到 1000,Sql 調整如下,奇跡發(fā)生了,命中了聯(lián)合索引,查詢時長為 0.316s,結果一致,只不過多返回來 500 條數(shù)據(jù)。問題得到了解決。經過多次實驗 Limit 大于 695 時就會命中聯(lián)合索引,查詢條件下的數(shù)據(jù)量是 79963,696/79963 大概占比是 0.0087,猜測當獲取數(shù)據(jù)比超過 0.0087 時,會選擇聯(lián)合索引,未找到源代碼驗證此結論。

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經過我們的驗證,其中第 2、5、6 三種方法都可以解決性能問題。為了不影響線上,我們立即修改代碼,并選擇了 force index 的方式,上線觀察一段時間后,數(shù)據(jù)庫 CPU 恢復正常,問題得到了解決。

6a9a7802-292c-11ed-ba43-dac502259ad0.png

3 事后分析

上線后問題得到了解決,同時也留給我了很多疑問。

為什么明明 where 條件中包含了聯(lián)合索引,卻未能命中,反而選擇了性能較慢的主鍵索引?

為什么在 order by 中增加了一個索引其他字段,就可以命中聯(lián)合索引了呢?

為什么我僅僅是將 limit 限制條件由原來的 500 調大后,也能命中聯(lián)合索引呢?

這一切的答案都來自 MySQL 的查詢優(yōu)化器。

3.1 查詢優(yōu)化器

查詢優(yōu)化器是專門負責優(yōu)化查詢語句的優(yōu)化器模塊,通過計算分析收集的各種系統(tǒng)統(tǒng)計信息,為查詢給出最優(yōu)的執(zhí)行計劃 —— 最優(yōu)的數(shù)據(jù)檢索方式。 優(yōu)化器決定如何執(zhí)行查詢的方式是基于一種稱為基于代價的優(yōu)化的方法。5.7 在代價類型上分為 IO、CPU、Memory。內存的代價收集了,但是并沒有參與最終的代價計算。Mysql 中引入了兩個系統(tǒng)表,mysql.server_cost 和 mysql.engine_cost,server_cost 對應 CPU 的代價,engine_cost 代表 IO 的代價。 server_cost(CPU 代價)

row_evaluate_cost (default 0.2) 計算符合條件的行的代價,行數(shù)越多,此項代價越大

memory_temptable_create_cost (default 2.0) 內存臨時表的創(chuàng)建代價

memory_temptable_row_cost (default 0.2) 內存臨時表的行代價

key_compare_cost (default 0.1) 鍵比較的代價,例如排序

disk_temptable_create_cost (default 40.0) 內部 myisam 或 innodb 臨時表的創(chuàng)建代價

disk_temptable_row_cost (default 1.0) 內部 myisam 或 innodb 臨時表的行代價

由上可以看出創(chuàng)建臨時表的代價是很高的,尤其是內部的 myisam 或 innodb 臨時表。 engine_cost(IO 代價)

io_block_read_cost (default 1.0) 從磁盤讀數(shù)據(jù)的代價,對 innodb 來說,表示從磁盤讀一個 page 的代價

memory_block_read_cost (default 1.0) 從內存讀數(shù)據(jù)的代價,對 innodb 來說,表示從 buffer pool 讀一個 page 的代價

這些信息都可以在數(shù)據(jù)庫中配置,當數(shù)據(jù)庫中未配置時,從 MySql 源代碼(5.7)中可以看到以上默認值情況

6ab9aaf6-292c-11ed-ba43-dac502259ad0.png

3.2 代價配置

poYBAGMQN2KAGZiXAABiuFnB6hE024.jpg

3.3 代價計算

代價是如何算出來的呢,通過讀 MySql 的源代碼,可以找到最終的答案 3.3.1 全表掃描(table_scan_cost) 以下代碼摘自 MySql Server(5.7 分支),全表掃描時,IO 與 CPU 的代價計算方式。

poYBAGMQN4OAI0MjAAE_FZ2z7ls735.jpg
pYYBAGMQN4uAHQ0zAADlMtj10YI285.jpg

根據(jù)源代碼分析,當表中包含 100 行數(shù)據(jù)時,全表掃描的成本為 23.1,計算邏輯如下

poYBAGMQN52AMqygAABZDU0N6c8455.jpg

驗證結果如下圖

6ad746ba-292c-11ed-ba43-dac502259ad0.png

3.3.2 索引掃描(index_scan_cost) 以下代碼摘自 MySql Server(5.7 分支),當出現(xiàn)索引掃描時,是如何進行計算的,核心代碼如下

pYYBAGMQN8iAKhoGAABfHEGQbbs544.jpg

io 代價計算核心代碼

//核心代碼
const double io_cost= index_only_read_time(index, rows) *
table->cost_model()->page_read_cost_index(index, 1.0);

// index_only_read_time(index, rows)
// 估算index占page個數(shù)

//page_read_cost_index(index, 1.0)
//根據(jù)buffer pool大小和索引大小來估算page in memory和in disk的比例,計算讀一個page的代價

cpu 代價計算核心代碼

pYYBAGMQN_OAAgS5AABfhflMzRE733.jpg


3.3.3 其他方式 計算代價的方式有很多,其他方式請參考 MySql 原代碼。https://github.com/mysql/mysql-server.git

3.4 深度解析

通過查看 optimizer_trace,可以了解查詢優(yōu)化器是如何選擇的索引。

pYYBAGMQOAqAd6a5AAClSllMXjo610.jpg

通過分析 rows_estimation 節(jié)點,可以看到通過全表掃描(table_scan)的話的代價是 8.29e6,同時也可以看到該查詢可以選擇到主鍵索引與聯(lián)合索引,如下圖。

6af7ba26-292c-11ed-ba43-dac502259ad0.png

上圖中全表掃描的代價是 8.29e6,我們轉換成普通計數(shù)法為 8290000,如果使用主鍵索引成本是 3530000,聯(lián)合索引 185881,最小的應該是 185881 聯(lián)合索引,也可以看到第一步通過成本分析確實選擇了我們的聯(lián)合索引。

6b1a2052-292c-11ed-ba43-dac502259ad0.png

6b2c6622-292c-11ed-ba43-dac502259ad0.png

6b3f857c-292c-11ed-ba43-dac502259ad0.png

但是為什么還是選擇了主鍵索引呢? 通過往下看,在 reconsidering_access_paths_for_index_ordering 節(jié)點下, 發(fā)現(xiàn)由于 Order by 導致重新選擇了索引,在下圖中可以看到主鍵索引可用(usable=true),我們的聯(lián)合索引為 not_applicable (不適用),意味著排序只能使用主鍵索引。

6b5f31c4-292c-11ed-ba43-dac502259ad0.png

接下來通過 index_order_summary 可以看出,執(zhí)行計劃最終被調整,由原來的聯(lián)合索引改成了主鍵索引,就是說這個選擇無視了之前的基于索引成本的選擇。

6b8978bc-292c-11ed-ba43-dac502259ad0.png

為什么會有這樣的一個選項呢,主要原因如下:

The short explanation is that the optimizer thinks — or should I say hopes — that scanning the whole table (which is already sorted by the id field) will find the limited rows quick enough, and that this will avoid a sort operation. So by trying to avoid a sort, the optimizer ends-up losing time scanning the table.

從這段解釋可以看出主要原因是由于我們使用了 order by id asc 這種基于 id 的排序寫法,優(yōu)化器認為排序是個昂貴的操作,所以為了避免排序,并且它認為 limit n 的 n 如果很小的話即使使用全表掃描也能很快執(zhí)行完,所以它選擇了全表掃描,也就避免了 id 的排序。

5 總結

查詢優(yōu)化器會基于代價來選擇最優(yōu)的執(zhí)行計劃,但由于 order by id limit n 的存在,MySql 可能會重新選擇一個錯誤的索引,忽略原有的基于代價選擇出來的索引,轉而選擇全表掃描的主鍵索引。這個問題在國內外有大量的用戶反饋,BUG 地址https://bugs.mysql.com/bug.php?id=97001。官方稱在 5.7.33 以后版本可以關閉 prefer_ordering_index 來解決。如下圖所示。

6ba69b36-292c-11ed-ba43-dac502259ad0.png

另外在我們日常慢 Sql 調優(yōu)時,可以通過以下兩種方式,了解更多查詢優(yōu)化器選擇過程。

poYBAGMQOFyAZk2CAACQfGRgS0c916.jpg

當你也出現(xiàn)了本篇文章碰到的問題時,可以采用以下的方法來解決

使用 force index,強制指定索引。

order by 中增加一個聯(lián)合索引的 key。

擴大 limit 返回的范圍(不推薦,隨著數(shù)據(jù)量的增大,可能還會走回主鍵索引)

order by (id+0) asc 欺騙查詢優(yōu)化器,讓其選擇聯(lián)合索引。

MySQL 5.7.33 版本以上,可以關閉 prefer_ordering_index 解決。



審核編輯:劉清

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原文標題:記錄一次數(shù)據(jù)庫CPU被打滿的排查過程

文章出處:【微信號:OSC開源社區(qū),微信公眾號:OSC開源社區(qū)】歡迎添加關注!文章轉載請注明出處。

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