雖然生成式 AI 一詞最近才變得家喻戶曉，但藥物研發(fā)公司英矽智能（Insilico Medicine）多年來(lái)一直使用它來(lái)開(kāi)發(fā)治療衰竭性疾病的新療法。

該公司早期在深度學(xué)習(xí)上的投入正取得成果——其利用 AI 平臺(tái)研發(fā)的一種候選藥物現(xiàn)在正進(jìn)入二期臨床試驗(yàn)，用于治療特發(fā)性肺纖維化，這是一種相對(duì)罕見(jiàn)的呼吸系統(tǒng)疾病，會(huì)導(dǎo)致肺功能逐漸下降。

英矽智能將生成式 AI 應(yīng)用于臨床前藥物研發(fā)流程的各個(gè)環(huán)節(jié)：確定藥物化合物可以靶點(diǎn)的分子、生成新的候選藥物、衡量這些候選藥物與靶點(diǎn)的結(jié)合程度，甚至預(yù)測(cè)臨床試驗(yàn)的結(jié)果。

使用傳統(tǒng)方法進(jìn)行這項(xiàng)工作需要花費(fèi)超過(guò) 4 億美元，耗時(shí)長(zhǎng)達(dá) 6 年。但是通過(guò)生成式 AI，英矽智能僅以十分之一的成本和三分之一的時(shí)間完成了這些工作，在項(xiàng)目啟動(dòng)兩年半后就進(jìn)入了一期臨床試驗(yàn)。

英矽智能首席執(zhí)行官 Alex Zhavoronkov 表示：“這個(gè)已進(jìn)入二期臨床試驗(yàn)的首個(gè)候選藥物是我們利用深度學(xué)習(xí)連接生物學(xué)和化學(xué)的端到端方法的真正亮點(diǎn)。這不僅對(duì)我們來(lái)說(shuō)是一座重要里程碑，對(duì)于整個(gè) AI 加速藥物研發(fā)領(lǐng)域亦是如此?！?/p>

英矽智能是 NVIDIA 初創(chuàng)加速計(jì)劃的高級(jí)成員。該免費(fèi)計(jì)劃為前沿初創(chuàng)企業(yè)提供技術(shù)培訓(xùn)、產(chǎn)品上市支持和 AI 平臺(tái)指導(dǎo)。該公司在其生成式 AI 藥物設(shè)計(jì)引擎 Chemistry42 中使用 NVIDIA Tensor Core GPU來(lái)生成新的分子結(jié)構(gòu)，并且是在 2015 年第一批采用 NVIDIA DGX 系統(tǒng)的企業(yè)之一。

AI 推動(dòng)實(shí)現(xiàn)端到端臨床前藥物研發(fā)

英矽智能的 Pharma.AI 平臺(tái)包括經(jīng)過(guò)數(shù)百萬(wàn)數(shù)據(jù)樣本訓(xùn)練后能適應(yīng)一系列任務(wù)的多個(gè) AI 模型。其中一個(gè) AI 工具 PandaOmics 能夠快速識(shí)別并優(yōu)先處理對(duì)疾病療效起重要作用的靶點(diǎn)，比如引起 COVID-19 的刺突蛋白。

Chemistry42 引擎可在幾天內(nèi)設(shè)計(jì)出采用 PandaOmics 識(shí)別出來(lái)的蛋白質(zhì)作為靶點(diǎn)的新型候選藥物化合物。這個(gè)生成式化學(xué)工具使用深度學(xué)習(xí)重新設(shè)計(jì)出類似藥物的分子結(jié)構(gòu)。

英矽智能AI 平臺(tái)主管 Petrina Kamya 表示：“通常，藥物研發(fā)領(lǐng)域的 AI 公司不是專注于生物學(xué)，就是專注于化學(xué)。而英矽智能從一開(kāi)始就將同一種深度學(xué)習(xí)方法應(yīng)用于這兩個(gè)領(lǐng)域，利用 AI 發(fā)現(xiàn)藥物靶點(diǎn)并生成小分子的化學(xué)結(jié)構(gòu)。”

多年來(lái)，英矽智能團(tuán)隊(duì)采用了不同種類的深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)研發(fā)藥物，包括生成式對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)和 transformer 模型。他們現(xiàn)在正在使用 NVIDIA BioNeMo，通過(guò)生成式 AI 加速早期藥物研發(fā)流程。

在 AI 堆棧中找到關(guān)鍵之處

為了開(kāi)發(fā)治療肺纖維化的候選藥物，英矽智能使用 Pharma.AI 設(shè)計(jì)并合成了約 80 個(gè)分子，取得了臨床前候選藥物前所未有的成功率。從確定靶點(diǎn)到提出一種極具潛力的候選藥物進(jìn)行試驗(yàn)，這一過(guò)程耗時(shí)不到 18 個(gè)月。

在二期臨床試驗(yàn)中，英矽智能的肺纖維化藥物將對(duì)美國(guó)和中國(guó)的數(shù)百名患者開(kāi)展試驗(yàn)。這個(gè)過(guò)程將需要幾個(gè)月的時(shí)間。與此同時(shí)，該公司還有 30 多個(gè)針對(duì)其他疾病的在研管線，包括一些抗癌藥物。

Zhavoronkov 表示：“當(dāng)我們第一次展示我們的結(jié)果時(shí)，人們只是不相信生成式 AI 系統(tǒng)可以達(dá)到這樣高的多樣性、新穎性和準(zhǔn)確性?，F(xiàn)在我們有了一整套極具潛力的候選藥物管線，所以人們開(kāi)始意識(shí)到這確實(shí)是可行的。”

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