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      電子發(fā)燒友網(wǎng)>電子資料下載>人工智能>支持BLASTgres中的生物索引詳細(xì)介紹

      支持BLASTgres中的生物索引詳細(xì)介紹

      2020-02-28 | pdf | 0.16 MB | 次下載 | 1積分

      資料介紹

      　　執(zhí)行全基因組和跨基因組數(shù)據(jù)分析的能力可以大大減少新的生物發(fā)現(xiàn)所需的時(shí)間。這就提出了生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)研究中涉及數(shù)據(jù)表示和數(shù)據(jù)集成的重要問(wèn)題。傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)不支持基本的生物數(shù)據(jù)類(lèi)型（如序列位置）和工具（如流行的BLAST序列比對(duì)工具），這迫使研究人員反直觀地表示生物知識(shí)，并實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)操作代碼。本文介紹了生物索引，一種用于表示和管理生物信息的概念性基礎(chǔ)設(shè)施，它允許在現(xiàn)代數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)中查詢這些信息。本文還描述了一個(gè)實(shí)現(xiàn)-BLASTgres，一個(gè)PostgreSQL數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)的擴(kuò)展-提供可索引的生物信息數(shù)據(jù)類(lèi)型和可連接的BLAST對(duì)齊。BLASTgres中的序列位置數(shù)據(jù)類(lèi)型具有特殊的意義，因?yàn)樗强伤饕模瑢?duì)BLAST生成的序列比對(duì)信息至關(guān)重要，并且在現(xiàn)有的生物信息中普遍存在。

      神經(jīng)網(wǎng)絡(luò) 數(shù)據(jù)庫(kù)
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