日前,哥倫比亞大學(xué)副教授亞尼弗·埃利奇(Yaniv Erlich)聯(lián)合蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院專家等在《自然—生物技術(shù)》上發(fā)表了一項(xiàng)最新成果。其研究團(tuán)隊(duì)通過3D打印制作了一只兔子,并且將這只兔子的三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)以雙鏈DNA結(jié)構(gòu)形式內(nèi)置在打印材料中。通過編碼和解碼,這只3D打印的兔子模型實(shí)現(xiàn)了其自身數(shù)據(jù)的DNA存儲(chǔ)和傳遞。亞尼弗·埃利奇表示,這項(xiàng)研究最大的突破在于證實(shí)了萬物皆可實(shí)現(xiàn)DNA存儲(chǔ)的理論,且不受任何形狀限制,從存儲(chǔ)密度來看,10噸DNA即可存儲(chǔ)人類已經(jīng)創(chuàng)造出的所有信息。
我們到底可以通過基因數(shù)據(jù)了解到哪些信息?我們還可以拿這些信息做些什么?基因還有哪些潛在的應(yīng)用?
數(shù)據(jù)存儲(chǔ)技術(shù)面臨挑戰(zhàn)
在過去的70年中,數(shù)據(jù)存儲(chǔ)技術(shù)在快速發(fā)展中也面臨挑戰(zhàn)?,F(xiàn)在有很多創(chuàng)新性技術(shù)可使每年的存儲(chǔ)成本降低30%,但隨著2010年創(chuàng)新的速度變緩,人們?nèi)院茈y把這些設(shè)備的成本降得更低。
20世紀(jì)70年代的影片可存在一張光碟上,但現(xiàn)在存在光盤中的信息很難被讀取了。那么, 是否DNA才是真正的存儲(chǔ)技術(shù)?在過去35億年中DNA都是存在的,而且未來也會(huì)繼續(xù)存在。相信未來我們依然需要借助DNA的力量。
理論上,DNA存儲(chǔ)相對(duì)傳統(tǒng)存儲(chǔ)方式優(yōu)勢(shì)明顯。一張光盤一旦出現(xiàn)刮痕就很難提取里面存儲(chǔ)的信息,其實(shí),任何數(shù)字技術(shù)都存在這樣的問題。但是,DNA就靠譜得多,哪怕幾千年前的殘骸,今天都可以通過DNA來了解當(dāng)時(shí)的情況。
信息可以存儲(chǔ)于一個(gè)DNA
實(shí)際應(yīng)用中,DNA是不是可以存儲(chǔ)信息呢?如何打造基于DNA的文件?
DNA是一個(gè)序列,它是幾種不同堿基的組合,這與計(jì)算機(jī)的存儲(chǔ)理念不謀而合。計(jì)算機(jī)世界里,不管是文本還是歌曲,每個(gè)文件都可以轉(zhuǎn)換成一個(gè)二進(jìn)制的序列,由0和1組成,并可以這種形式存儲(chǔ)。
如果你想讀取DNA信息的話,可以將其放到序列儀上,通過測(cè)序儀來讀取存儲(chǔ)的數(shù)據(jù)。
現(xiàn)在我的團(tuán)隊(duì)希望能夠?qū)⑦@一理念化為現(xiàn)實(shí)。此前,我們將一部電影放到DNA中,用計(jì)算機(jī)操作系統(tǒng)成功讀取出來,并且沒有任何數(shù)據(jù)缺失。
但是,這項(xiàng)技術(shù)也存在缺點(diǎn)。讀取文件時(shí),需要提取的DNA是在液體中的一部分,如果接連不斷地測(cè)序的話,可能最終樣本量會(huì)越來越少。
怎么辦?我們希望借助細(xì)胞增殖解決這一問題。細(xì)胞在增殖過程中不斷地進(jìn)行DNA的復(fù)制,我們可以通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)技術(shù)(PCR)做一個(gè)類似的擴(kuò)增,這一工作可以在實(shí)驗(yàn)室完成。
如何避免DNA復(fù)制的錯(cuò)誤?研究人員開發(fā)出一套糾錯(cuò)代碼,即使復(fù)制過程中出現(xiàn)錯(cuò)誤,也可以及時(shí)糾正過來。
另外,我們做了一個(gè)實(shí)驗(yàn),希望了解一個(gè)DNA最多可以儲(chǔ)存多少信息。研究發(fā)現(xiàn),每一個(gè)DNA上可以有125艾字節(jié)(EB)的信息。這是多少呢?如果一個(gè)房間里全都是筆記本電腦的話,它們所存儲(chǔ)的所有信息都可以集中到一個(gè)DNA上。
“兔子”實(shí)證DNA存儲(chǔ)可行
人類所創(chuàng)造的數(shù)據(jù)總量大約是10的24次方,我們只需要10噸的DNA就可以儲(chǔ)存所有的數(shù)字信息。這10噸的DNA可以裝到一個(gè)大卡車上。
那為什么不能讓這項(xiàng)技術(shù)為更多人所用呢?把小小的DNA做成一般物品,以儲(chǔ)存信息。
我們希望解放試管中的DNA,把它放到很小的硅珠當(dāng)中,然后用膠囊把硅珠封住,再把這些小珠放到聚合物里面,比如說塑料,最后把塑料做成我們想要的一些東西或者是形狀。
這只3D打印的小兔子不一般,因?yàn)檫@只兔子的DNA里寫了如何打印這只兔子的指令。也就是說,兔子里有生產(chǎn)它的具體指令,保存于硅珠中,硅珠里有DNA,這個(gè)DNA就是如何制造這只小兔子的生產(chǎn)信息。日常使用中,我們只需要把這只小兔子的耳朵折下一點(diǎn),讀取DNA信息,進(jìn)行復(fù)制,就可以生產(chǎn)新的小兔子。 就像兔子繁殖一樣,我們可以不斷地復(fù)制、不斷地迭代。
測(cè)試發(fā)現(xiàn),生產(chǎn)了6代這樣的兔子,我們還是能從最后一代兔子里提取到最原始的信息,沒有任何的錯(cuò)誤。
這項(xiàng)技術(shù)有何實(shí)際應(yīng)用?首先,我們可以把各種材料的生產(chǎn)方式放到材料里面,比如可以在植入物中放入病人的診療信息。若干年后,可能患者的病歷已經(jīng)難以找到,但只需從這名患者體內(nèi)拿出這個(gè)植入物就可以了解其過去的健康情況。我們也可以用同樣的方式來生產(chǎn)汽車部件。
其次,可應(yīng)用于隱藏信息。我們可以把一些常見的東西或物件當(dāng)作隱藏信息的載體,比如鞋帶、鏡片、襯衣、扣子等,所有這些物件都可以幫助我們儲(chǔ)存和隱藏信息。甚至我們可以像喝飲料一樣,把硅珠喝到肚子里,需要的時(shí)候再把它排泄出來。
再次,可應(yīng)用于自我復(fù)制的機(jī)器人。通常機(jī)器人是無法自我復(fù)制的,但是自我復(fù)制機(jī)器人有能力把自己的生產(chǎn)方式傳遞給下一代機(jī)器人。
DNA有可能是我們終極的存儲(chǔ)設(shè)備。它的存儲(chǔ)密度要比其他存儲(chǔ)技術(shù)高,存儲(chǔ)時(shí)間也更久,而且提取簡(jiǎn)單。人類只要使用一臺(tái)普通的DNA測(cè)序儀,就可以把信息解析出來。同時(shí),由于沒有材料或形狀的限制,我們可以把DNA注入日常物件中,使存儲(chǔ)信息成為我們生活的一部分。(來源:中國(guó)科學(xué)報(bào) 沈春蕾)
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