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在實(shí)踐應(yīng)用中極具潛力的圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(GNNs)

獨(dú)愛72H ? 來源:讀芯術(shù) ? 作者:讀芯術(shù) ? 2020-03-15 23:13 ? 次閱讀
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(文章來源:讀芯術(shù))
深度學(xué)習(xí)已經(jīng)改變了我們處理數(shù)據(jù)的方式,通過使用日益增長的計(jì)算“廉價(jià)”資源(摩爾定律)來解決現(xiàn)實(shí)世界問題,并且能夠完成一些人腦幾乎毫不費(fèi)力就能完成的認(rèn)知任務(wù),例如圖像分類,自然語言處理,視頻處理等等。

但這些任務(wù)具有的大多數(shù)數(shù)據(jù)和結(jié)構(gòu)通常是在歐幾里得空間中表示的。然而,我們目睹了越來越多的問題,這些問題生成的數(shù)據(jù)來自非歐幾里得域,它們更適合被表示為具有復(fù)雜關(guān)系和對象之間相互依賴關(guān)系的圖。圖數(shù)據(jù)的復(fù)雜性給經(jīng)典ML算法和現(xiàn)代DL算法帶來了重大挑戰(zhàn)。近來出現(xiàn)了許多擴(kuò)展DL方法使之用于圖數(shù)據(jù)的研究。

花點(diǎn)時(shí)間想像一下,如果我們收集了所有“獲批”藥物或一般藥物的結(jié)構(gòu),并訓(xùn)練一個(gè)GNN來學(xué)習(xí)藥物的分子模式/結(jié)構(gòu),它會學(xué)會識別在此處或太空中發(fā)現(xiàn)的分子是不是藥物。我相信結(jié)果可能相當(dāng)令人驚訝,并且能幫助我們發(fā)現(xiàn)或重新發(fā)現(xiàn)可以治愈如今被認(rèn)為無法治愈的疾病的藥物。如果考慮大多數(shù)疾病甚至死亡本身都可以看作是技術(shù)問題。那么為什么有些生物可以活幾百年而有些只能活幾十年?我們可以無限延長壽命嗎?

GNNs與對應(yīng)的DL算法具有相似的屬性,它能夠進(jìn)行回歸,分類,為空節(jié)點(diǎn)和邊生成數(shù)據(jù),以及許多尚待發(fā)現(xiàn)的功能。該領(lǐng)域仍處于起步階段,誰也不知道幾年內(nèi)我們能做些什么,以及用從現(xiàn)在開始的幾千篇論文做些什么。對我來說,最有趣的是推薦以及醫(yī)療領(lǐng)域的應(yīng)用,其中醫(yī)療領(lǐng)域?yàn)閚o.1。

如今,圖可能是不規(guī)則的,一張圖可能具有可變數(shù)目的無序節(jié)點(diǎn),并且圖中節(jié)點(diǎn)可能具有不同數(shù)量的鄰居,從而導(dǎo)致一些在圖像領(lǐng)域中易于計(jì)算的重要的操作(例如卷積),很難應(yīng)用于圖域。此外,現(xiàn)有機(jī)器學(xué)習(xí)算法的核心假設(shè)是實(shí)體相互獨(dú)立。該假設(shè)不再適用于圖數(shù)據(jù),因?yàn)槊總€(gè)實(shí)體(節(jié)點(diǎn))通過各種類別的鏈接(例如引文,好友和交互)與其他實(shí)體(節(jié)點(diǎn))相關(guān)聯(lián)。但這不是障礙,因?yàn)樽罱覀兛吹饺藗儗U(kuò)展或者應(yīng)該說是移植深度學(xué)習(xí)算法到圖領(lǐng)域(尤其是設(shè)計(jì)來用于圖數(shù)據(jù))的興趣日益濃厚。

卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(ConvNets)不在本文討論范圍之內(nèi)。循環(huán)圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(RecGNNs)大多是圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的開創(chuàng)性作品。RecGNN旨在學(xué)習(xí)具有循環(huán)神經(jīng)架構(gòu)的節(jié)點(diǎn)表示。它們假設(shè)圖中的節(jié)點(diǎn)不斷與其鄰居交換信息/消息,直到達(dá)到穩(wěn)定的平衡。RecGNNs在理論上很重要,它啟發(fā)了后來對卷積圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的研究。特別地,消息傳遞的思想被基于空間的卷積圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)所繼承。

卷積圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(ConvGNNs)將卷積運(yùn)算從網(wǎng)格數(shù)據(jù)推廣到了圖形數(shù)據(jù)。主要思想是通過聚合節(jié)點(diǎn)自身的特征和鄰居的特征來生成節(jié)點(diǎn)的表示,其中。與RecGNNs不同,ConvGNNs堆疊多個(gè)圖卷積層以提取高級節(jié)點(diǎn)表示。ConvGNNs在建立許多其它的復(fù)雜GNN模型中起著核心作用。圖2a展示了用于節(jié)點(diǎn)分類的ConvGNN。圖2b展示了用于圖分類的ConvGNN。

圖自動編碼器(GAEs)是無監(jiān)督的學(xué)習(xí)框架,可將節(jié)點(diǎn)/圖編碼到潛在的矢量空間中,并通過編碼后的信息重建圖數(shù)據(jù)。GAEs用于學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)嵌入和圖生成分布。對于網(wǎng)絡(luò)嵌入,GAEs通過重建圖結(jié)構(gòu)信息(例如圖鄰接矩陣)來學(xué)習(xí)潛在節(jié)點(diǎn)表示。對于圖生成,某些方法逐步生成圖的節(jié)點(diǎn)和邊,而其他方法則一次全部輸出圖形。圖2c展示了一個(gè)用于網(wǎng)絡(luò)嵌入的GAE。

時(shí)空圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(STGNNs)旨在從時(shí)空圖中學(xué)習(xí)隱藏的模式,這種模式在各種應(yīng)用中變得越來越重要,例如交通速度預(yù)測,駕駛員操縱預(yù)期和人類動作識別。STGNNs的關(guān)鍵思想是同時(shí)考慮空間依賴性和時(shí)間依賴性。許多當(dāng)前的方法將用來捕獲空間依賴性的圖卷積和用來對時(shí)間依賴性進(jìn)行建模的RNNs或CN

圖分類旨在預(yù)測整個(gè)圖的類標(biāo)簽??梢酝ㄟ^圖卷積層,圖池層和/或讀出層的組合來實(shí)現(xiàn)此任務(wù)的端到端學(xué)習(xí)。圖卷積層負(fù)責(zé)精確的高級節(jié)點(diǎn)表示,而圖池化層則充當(dāng)下采樣的角色,從而每次將每個(gè)圖都粗化為子結(jié)構(gòu)。讀出層將每個(gè)圖的節(jié)點(diǎn)表示折疊為圖表示。通過將多層感知器和softmax層應(yīng)用于圖表示,我們可以構(gòu)建用于圖分類的端到端框架。在圖2b中給出了一個(gè)例子。

當(dāng)圖中沒有可用的類標(biāo)簽時(shí),可以在端到端框架中以完全無監(jiān)督的方式學(xué)習(xí)圖嵌入。這些算法以兩種方式利用邊級信息。一種簡單的方法是采用自動編碼器框架,其編碼器使用圖卷積層將圖嵌入到潛在表示中,在其上使用解碼器來重構(gòu)圖結(jié)構(gòu)。另一種流行的方法是利用負(fù)采樣方法,該方法將一部分節(jié)點(diǎn)對采樣為負(fù)對,而圖中具有鏈接的現(xiàn)有節(jié)點(diǎn)對為正對。然后應(yīng)用邏輯回歸層來區(qū)分正對和負(fù)對。
(責(zé)任編輯:fqj)

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